说说边界条件 gemin

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Dec 3, 2008, 6:48:43 AM12/3/08
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说说边界条件
忘了在哪本分子模拟的书上看到然后作下的笔记:
1.自由边界(即lammps中的s):常用于大型的自由分子的模拟
2.固定边界(f):在所有要计算到的粒子晶胞之外再包上几层结构相同的位置不变的粒子,包层的厚度必须大于粒子间的相互作用的力程范围。包层部分代表
了与运动粒子起作用的宏观晶体的一部分。适用于点缺陷的研究。
3.柔性边界(m):允许边界上的粒子有微小移动以反映内层粒子的作用力施加到它们身上的情况。适于位错运动等缺陷延伸的研究。
4.周期性边界(p):让晶胞左边的粒子与右边的粒子有相互作用,上下及前后同。晶胞限度大于单个粒子作用力程的二倍。适于表面及边界问题的模拟。

其中周期性边界相当于在无数个相同镜像在周围, 那么是否这种边界对模拟的影响最复杂?不明白为什么使用fix deform时一定要设为周期边界?而
在周期边界下进行模型的趋衡时,能量温度都很难控制,邻居列表数也是超级大。
期待哪们比较了解这个问题的能谈谈这几种边界条件的区别及适用情况

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