高回报征集LAMMPS使用经验
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自从我知道这世上还有LAMMPS这般好东西，想来也有一年半了。这一年半的时间，除了自己硬肯手册，多是各位网友的帮助，好生感激。以前也写过一个新
手的学习指南，承蒙各位的赏识，看过的人还觉得不错，只是那个仅是出门级的心得，如果用过LAMMPS一段时间了，再看那个，确实误导不少。
我想咱们用现成的软件或代码做分子模拟的，大都不想成为软件的奴隶，都想弄清楚软件的内在，这也是我最近多次看LAMMPS手册的意图。
确实，手册里后面那几百页关于各个命令的详细解释，是要首先了解的，至少知道LAMMPS有哪些命令，不要求全部精通，大体应该知道LAMMPS的各个
命令能实现什么功能。
纵观LAMMPS手册，除了这几百页，前面的大概一百页中，好东西实在是太多。
第一章的前三节，是对LAMMPS感兴趣的人必须要看的，如同一篇Paper的Abstract。我在企图翻译一下这三节，如果哪位想一起合作，是再好
不过了。
新手遇到的很多难题是LAMMPS如何编译。编译linux系统的版本也罢，还是想编译windows版本也罢，其实手册里说的是再清楚不过了。不管是
小弟以前写的一些东西，还是网上的其它什么编译教程，都是LAMMPS手册2.2节，2.3节两部分的一个子集罢了。如果你遇到的种种编译过程中的难
题，这两节都说的很清楚了，与其在网上求救，等别人回答，还不如仔细把这两节好好研究一番。最后再说一句，编译windows版本的LAMMPS，个人
实在是不推荐这么做，有那个功夫，早就掌握了linux的初步应用了。
手册第三章的前3节，写的真是精辟。虽然很是简短，我看了之后，之前存在的好多疑惑烟消云散。编译完LAMMPS的新手，大都问in文件怎么写，这3
节，应该是给出了详细的回答。
手册的第4章，标题都已经很明确了，How to，有些明确的问题，还要在这里看看相应的章节。
手册第5，6两章，内容确实简单，不再多说。
第7章，如果你感慨LAMMPS的前后处理功能不行，不妨借用一些tool。单说建模，都说MS好使，这里面的msi2lmp工具，真是方便，那个
readme文件，才区区两页，弄懂了，怕是就不可能生成不了想在LAMMPS使用的模型。其它的工具，我用的还真是不多，有了心得，再跟大家分享。
LAMMPS的功能强大还表现在其可扩展性，读了第8章，如果有些C++的基础的话，使得LAMMPS更加强大就方便多了，LAMMPS的架构设计的真
是巧妙，很是方便用户扩展。
第9章的报错信息，一般的错误都在这里有提示，可能有些提示的有些模糊，但是见过很多人遇到的错误，其实这里面都有解释。至于更详细的错误解决，还需对
LAMMPS的深层次理解。
我是越来越感慨LAMMPS的手册写的详细，不知道凝结了多少人的心血。LAMMPS的代码也写的干净利落，像我这样根本不懂C++的人，一边看着C+
+的教程，一边吃LAMMPS的代码，也觉得有路可循。
要想驾驭LAMMPS，还得从其手册，从其代码入手。也很高兴，在这里遇到这么多同仁，希望大家多多分享自己的心得，共同提高。
以上说的很笼统，细节的东西，我还在整理，将不定期奉上，希望大家多指正。
LAMMPS手册对命令的介绍和使用，写的还不错，但对MD的基础只是方面涉及的太少了【和gmx的相比】
另外LAMMPS的命令使用的实例值得参考，那里面我觉得都是大家以前常用的设置，LAMMPS开发者都是各个领域做模拟的高手