チェック項目をこのサイトの通りにして、use mac driver instead of X11を選び、fontsの「cjkfonts」にチェックを入れてから「Run」をクリックしました。
ここまでしたあと、safebootを止めて通常起動しましたら、JW-Cad 8.0bのアイコンクリックで問題なく起動できるようになりました。
また、アプリ内のWineskinもbusyにならず設定できるようになっていました。
そうすると、safe boot で起動したのが良かったのか、Wineskinを出し入れしたのが良かったのか、今となってはわかりませんが、今は問題なく動作してくれます。