Por ahora no he probado jQuery4PHP con Zend2 pero con Symfony2 realizamos la integracion con su motor de plantillas (Twig) El bundle se llama SmarTwig.
Para integrar jQuery4PHP con Zf2 no debe haber problema solo incluir este archivo en el autoload del framework.
YepSua/Labs/RIA/jQuery4PHP/jquery4php_required.php
Si Zf2 utiliza composer para las dependencias (creo que si) entonces solo debes colocar las dependencia en el archivo composer.json:
"require": {
"yepsua/jQuery4PHP": "1.0.*"
},
Una pregunta will ¿Zf2 utiliza algun motor de plantillas?
Saludos.