no entiendo que quisiste decir exactamente.
sera que tienes 2 app.
app1.. app2(contiene un jdesktopane, jinternalFrameAgregar)
quieres desde app1 , intanciar y poner el jinternalframeAgregar dentro del jdestokpane del app2 ?
si las app1 y app2, se ejecutan independientemente, lo que se me ocurre es que lo hagas por socket.
uno haga de cliente y el otro de servidor, y asi puedas comunicar tus 2 app y hacer lo que desees en uno u otro lado.
SI lo que entendi no es el caso, seria bueno que nos expliques con mas claridad, y asi poder hacerte sugerencias.
Saludos.
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"La Vida es un Vaiven de Tristezas y Alegrias"
"Se lo que quieres ser, ve a donde quieres ir, ya que solo tienes una vida
y una oportunidad para ser y hacer todo lo que quieras y te propongas"
Javier Callo Quispe
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Lima, Peru