Pregunta sobre isotopos en biofilm y algas

[Julian Torres]

Buenas tardes,

Quizás alguno de ustedes tenga más experiencia que yo en análisis de isótopos en alga y biofilm y pueda desburrarme.

Como parte de un proyecto para estudiar la estructura trófica en un lago craterico tropical oligotrófico, mandamos muestras de alga y biofilm a analisar y los resultados me confunden un poco ya que no  los esperaba.

Las algas resultaran ser altamente variables, con muchísima diferencia entre muestras y valores super altos de nitrógeno (media C=-13,17, rango =-22,97 a -9,15;  media N=6,80, rango =1,12 a 10,55; n= 10).

El biofilm me sorprendió más, ya que tenía valores positivos de C (media C=-4,24, rango =-8,48 a 1,24;  media N=5,80, rango =4,73 a 6,27; n= 5).

Ustedes consideran estos valores, incluyendo la gran variación normal, o creen, como yo, que algo salió mal en el análisis?

Gracias,

Julián

[Luciano Valenzuela]

Julian,

complejo....

para saber si hubo algún problema con el análisis de isotopos tenes que ver algunos de las otras variables y parámetros resultantes del análisis. Que te reportaron desde el laboratorio? Mínimo tenes que tener %C, %N (C/N), pero quizás tenes algún archivo con los parámetros usados para el análisis o las variables (áreas, vltage, etc etc). Si "ellos" (no se que lab sera) no te reportan que hubo problemas con las muestras entonces no tendrías porque dudar.

Pudo haber algún problema en el tratamiento y preservación de las muestras.. eso no se.

Descontando problemas de preservación o de análisis. Ya has analizado algo similar? Digo para tener valores de referencia.

Los valores de nitrógeno de las algas pueden parecer altos. Que algas son? Te parece que en el sistema habría nitrificacion? desnitrificacion? tenes que pensar eso. El rango es raro, pero sin saber si las muestras son replicas o son distintos, tiempos, lugares etc., la verdad es dificil saber.

En cuanto al biofilm..... biofilms bacterianos son difíciles... todo bacteriano es difícil.... las bacterias(como grupo general) son capaces prácticamente de todos los pathways metablicos, asi que cualquier fraccionamiento es esperable... muchas cosas pueden estar ocurriendo, desde distintas fuentes de Carbono, hasta distintos fraccionamientos... or ejemplo: tendras algunas metanogenicas? cualquier reacción que involucre producción de metano vas a tener fraccionamientos enooormes para producir metano con valores muy negativos (con el resultante "byproduct" positivo) ...

Luciano

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Dr. Luciano O. Valenzuela

Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET)
   Laboratorio de Ecología Evolutiva Humana - LEEH

   Núcleo de Estudios Interdisciplinarios sobre Poblaciones Humanas de Patagonia Austral - NEIPHPA

   Facultad de Ciencias Sociales, Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires
   Unidad de Enseñanza Universitaria Quequén
   Calle 508 Nº 881, Quequén, Buenos Aires, CP 7631, Argentina
      http://www.quequen.unicen.edu.ar/leeh/

     

Research Assistant Professor

   Department of Biology, University of Utah

      http://ecophys.utah.edu/

Voluntario-Investigador

   Instituto de Conservación de Ballenas

      www.icb.org.ar

[Julian Torres]

Gracias Luciano,

Desde el laboratorio (Konstanz) no me reportaron nada raro.  Tengo los valores de  %C, %N, %S y C/N. Esos valores no me parecen llamativamente raros, el C/N esta dentro del rango esperable para productores primarios (~15).

No analizamos nada así antes, así que no tengo referencias. Colectamos replicas de un tipo de alga filamentosa todas al mismo tiempo. Por eso me parece tan rara la variación. No es un lago nitrificado, a mi entender, pero quizás debería ver mas detalles.

Puede ser la preservación. Las muestras fueron colectadas y secadas en una estufa a 60 grados. Quizás ese no sea el mejor método para algas, no lo sé, aunque debería :P

Gracias por la ayuda,

Julián

2016-09-14 19:31 GMT+02:00 Luciano Valenzuela <lucianoov...@gmail.com>:

Julian,

complejo....

para saber si hubo algún problema con el análisis de isotopos tenes que ver algunos de las otras variables y parámetros resultantes del análisis. Que te reportaron desde el laboratorio? Mínimo tenes que tener %C, %N (C/N), pero quizás tenes algún archivo con los parámetros usados para el análisis o las variables (áreas, vltage, etc etc). Si "ellos" (no se que lab sera) no te reportan que hubo problemas con las muestras entonces no tendrías porque dudar.

Pudo haber algún problema en el tratamiento y preservación de las muestras.. eso no se.

Descontando problemas de preservación o de análisis. Ya has analizado algo similar? Digo para tener valores de referencia.

Los valores de nitrógeno de las algas pueden parecer altos. Que algas son? Te parece que en el sistema habría nitrificacion? desnitrificacion? tenes que pensar eso. El rango es raro, pero sin saber si las muestras son replicas o son distintos, tiempos, lugares etc., la verdad es dificil saber.

En cuanto al biofilm..... biofilms bacterianos son difíciles... todo bacteriano es difícil.... las bacterias(como grupo general) son capaces prácticamente de todos los pathways metablicos, asi que cualquier fraccionamiento es esperable... muchas cosas pueden estar ocurriendo, desde distintas fuentes de Carbono, hasta distintos fraccionamientos... or ejemplo: tendras algunas metanogenicas? cualquier reacción que involucre producción de metano vas a tener fraccionamientos enooormes para producir metano con valores muy negativos (con el resultante "byproduct" positivo) ...

Luciano

On Wed, Sep 14, 2016 at 12:39 PM Julian Torres <torres...@gmail.com> wrote:

Buenas tardes,

Quizás alguno de ustedes tenga más experiencia que yo en análisis de isótopos en alga y biofilm y pueda desburrarme.

Como parte de un proyecto para estudiar la estructura trófica en un lago craterico tropical oligotrófico, mandamos muestras de alga y biofilm a analisar y los resultados me confunden un poco ya que no  los esperaba.

Las algas resultaran ser altamente variables, con muchísima diferencia entre muestras y valores super altos de nitrógeno (media C=-13,17, rango =-22,97 a -9,15;  media N=6,80, rango =1,12 a 10,55; n= 10).

El biofilm me sorprendió más, ya que tenía valores positivos de C (media C=-4,24, rango =-8,48 a 1,24;  media N=5,80, rango =4,73 a 6,27; n= 5).

Ustedes consideran estos valores, incluyendo la gran variación normal, o creen, como yo, que algo salió mal en el análisis?

Gracias,

Julián

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Dr. Luciano O. Valenzuela

Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET)
   Laboratorio de Ecología Evolutiva Humana - LEEH

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Research Assistant Professor

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[Felipe Docmac M.]

Si tienes material calcáreo en el biofilm esto puede ser una razón del por qué los valores  para ẟ13C son erróneamente más positivos. Si este es el caso, quizás haya que separar la muestra y acidificar aquella parte que va para análisis de C.

FD

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[Luciano Valenzuela]

Exacto.... y quizás el %C y el C/N te de una indicación de esto.

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