また一旦、ログビューア(初回起動時に自動で)過去テキストログを取り込む(=DB変換する)と、それ以降は過去テキストログは参照しません。
次のバージョンから、メッセージ単位で SJIS / UTF-8 識別を行う予定ですが、
現時点での対処は、下記になります。
1.SJISとUTF-8の混在を無くしたログを作成する(2つにわける or どちらかに統一する)
2.ログビューアから、ファイル(F)→「過去ログ取込&削除」を選択して、LogImportダイアログを出す
3.そこから、文字化けの原因となった自動取り込み(おそらくNo.1の行)を選択して「削除」を実行
4.そこから、「追加」ボタンを押して、1で作成したログファイルの取り込む