Prova a leggere i log del server per vedere dove si è interrotta la scansione di quel sito.
Generalmente il parser non va più avanti quando il server rifiuta le richiesta di download. per questo devi cercare di capire se si tratta di un problema del tuo sito o del tuo server. Anche un software per la protezione del server (Firewall, FailBan2, Mod Security, ecc.) potrebbe ad esempio bloccare la scansione di quel sito perchè richiede le pagine troppo velocemente e senza pause. Se ci sono sistemi di protezione che impediscono questo tipo di scansioni ecco che il server non risponde più e quel sito ti mostra quell'errore.
Mi spiace ma non so come altro aiutarti senza avere accesso al server e all'intero sito. E anche quetso non potrei farlo "gratuitamente" ma dovresti richiedermi di intervenire professionalmente.
saluti