BioInformática e BioLabbing no Garoa

[Vinicius Mesel]

Olá mundo,

Tudo bom com vocês?

Para quem não me conhece, sou Vinicius Mesel e sou um estudante de iniciação ciêntifica do instituto Butantan na área de Gênomica em Eucariotos.

Eu, como um aprendiz de bioinformata, estou desenvolvendo um software de armazenamento de arquivos de sequencias genéticas chamado FastaDB (Fasta por ser o nome da extensão e DB por se tratar de um banco de dados).

Para quem estiver interessado em contribuir para o projeto, logo logo disponibilizarei ele no GitHub, e se vocês tiverem interesse podemos retomar alguns projetos de biolab em parceria com o meu coordenador de IC, assim podemos desenvolver os equipamentos por meio DIY.

Se possível, algum mod pode criar a tag biologia para usarmos aqui no groups?

Abraços,

Vinicius Mesel

http://www.vmesel.com/

[Adriano]

  Oi, Vinicius. Tudo bem?

  Há uns 15 anos eu trabalhei bastante com bioinformática no IQ-USP. Trabalhei no antigo laboratório do Prof. Dorry, que ficava próximo do laboratório do Prof. Verjovski.

  Na época utilizávamos o phred, phrap e o consed e montamos alguns bancos de genona, entre eles de Hepatite C e Trichoderma reesei.

  Não sei se ainda é assim até hoje, mas antigamente fazíamos o cruzamento dos dados com o banco de dados do NCBI.

  Qual o propósito de armazenar os arquivos fasta em um banco de dados? Além de armazenar os arquivos, o que mais você pretende fazer?

  Não sei se você sabe, mas tínhamos um grupo de Biohacking no Garoa, mas acho que eles andam meio inativos:

  https://garoa.net.br/wiki/Biohacking

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