The problem of incompatible Charmm force field parameters

[niannan yao]

当我使用CHARMM36M力场对膜系统中的蛋白质-蛋白质复合物进行分子动力学模拟时，我在执行 MMPBSA 计算时遇到了一个问题。我发现无法计算结合能量。我无法将磷脂等分子转换为所需的格式？我该怎么办？我应该切换到不同的力场还是有其他更好的方法？

[marioe911116]

Please check this tutorial

https://valdes-tresanco-ms.github.io/gmx_MMPBSA/dev/examples/Protein_membrane/