Pozdrav

[Gregor Gorjanc]

Pozdravljeni,

To je dopisna skupina v katero ste bili pozvani predvsem zaradi našega sodelovanja. Žal se me seboj vsi ne poznate ali pa poznate le bežno. Z namenom, da bi ustvarili nekoliko bolj aktivno sodelovanje in širjenje znanja med vami smo ustvarili to dopisno skupino. Ideja te skupine je, da bi si med seboj delili tehnike, rezultate, poglede, razpravo, ... Sam se bom skušal čim bolj udeleževati diskusij, a namen je predvsem, da sami prevzamete pobudo. Zato vsakega izmed vas prosim, da na kratko predstavi sebe in svoj trenutni "projekt".

lp, Gregor

[Janez Jenko]

Ok, bom jaz začel

Najprej pa eno splošno vprašanje:
Glede na to, da imamo člani skupine 2 različna materina jezika me zanima, če bomo v naših dopisovanjih uporabljali slovenščino/hrvaščino/angleščino?

Vse člane skupine osebno ne poznam in zato najprej nekaj osnovnih informacij.

Ime: Janez
Priimek: Jenko
Zaposlen: Kmetijski Inštitut Slovenije od 2006 dalje
Podiplomski študij: Genetika na BF
Mentor: prof. dr. Milena Kovač
Naslov disertacije: Genetic evalaution of lifetime milk production in dairy cows
Rok za končanje doktorata: čimpreje
Računalniški programi, ki jih pogosto uporabljam: R, Survival Kit, Wombat, SQL Developer, Zotero (Citation style language)
Kje se želim izboljšati in kaj naučiti: R, Wombat, Fortran, Bash Scripting, BlupF90...

Trenutno delam intenzivno na Wombatu z naključno regresijo. Vzporedno peljem projekt vročinski stres ter sodelujem pri nekaterih stalnih nalogah v govedoreji. Pretekle izkušnje imam predvsem na področju genetske analize dolgoživosti in ocene dnevnih rezultatov kontrole prireje mleka.

Interesi za prihodnost: Genomska selekcija

lp, Janez

[Gregor Gorjanc]

Glede jezika predlagam "mešanico" slovenščine, (srbo-)hrvaščine in angleščine, ker vam bo to hkrati prišlo prav tudi v vsakdanjem življenju in pri delu.

gg

[Vesna Mrak]

Živijo,

še jaz ... malo manj izčrpno kot Janez.

Ime:                                    Vesna
Priimek:                               Mrak
Zaposlena:                           Biotehniška fakulteta, Oddeleka za zootehniko, Katedra za genetiko, animalno biotehnologijo in imunologijo
Delo:                                   delo z laboratorijskimi živalmi (miši, podgane), genotipizacija (PCR, elektroforeza, ...), izolacija DNA, RNA, ...
Podiplomski študij:               Statistika (modul biostatistika) na Univerzi v Ljubljani
Mentor:                                doc. dr. Gregor Gorjanc
Naslov disertacije:                Prediction of genotypic values of complex traits using homozygous genome regions among individuals
Rok za končanje doktorata:   september 2015

Kje se želim izboljšati in kaj naučiti:    Seznam je predolg za tale e-mail, ampak gremo po korakih.
                                                        Za začetek torej:

1) suverena uporaba R-a in Linuxovega terminala
2) programiranja

Z doktorsko nalogo sem še zelo zelo na začetku, tako da o tem kasneje, ko bodo vidni kakšni rezultati.

Lep sončen preostanek dneva. ;)

LP,
Vesna

[Ante Kasap]

Pozdravljam, 

Ime: Ante 
Prezime: Kasap
Zaposlen: Agronomski fakultet, Zagreb
Studij: Poljoprivredne Znanosti 
Mentor: Prof. dr. sc, Boro Mioč

Naslov disertacije:  ???  :)    ???

Rok za končanje doktorata:   august  2015.

Programi koje često koristim: SAS, R, VCE  

Područje rada: mali preživači  

Znanstveni interes: - kvantitativna genetika i genomska selekcija  

2013/4/10 Gregor Gorjanc <gregor....@gmail.com>

[Marija Spehar]

Bok svima,

Nekoliko osnovnih informacija o meni.

Ime: Marija
Prezime: Špehar
Zaposlena: Hrvatska poljoprivredna agencija
Podiplomski študij: Zotehnika na BF

Mentor: doc. dr. Gregor Gorjanc

Naslov disertacije: Genomic evaluation and genome-wide association studies in dairy cattle Rok za završetak doktorata: što prije

Trenutni rad: rutinski izračun UV svojstava mliječnosti, mesnatosti, fitnesa i vanštine goveda, mliječnosti ovaca i koza. U sklopu doktorske diseratcije trenutno radim članek o točnosti genomske predikcije za svojstva mliječnosti slovenske brown-swiss populacije. Još ću raditi na pleiotropskom efektu gena na svojstva mliječnosti i mesnatosti.
Što bi htjela poboljšati: priprema genomskih podataka, R, alphadrop, Blupf90,

lp svima iz ZG

marija

2013/4/10 Vesna Mrak <vesna...@gmail.com>

[Barbara Bračič]

Lepo pozdravljeni še iz moje strani. Janez je lepo začel s svojo predstavitvijo, po kateri ste nadaljevali in bom tudi jaz.

Ime: Barbara
Priimek: Bračič
Zaposlena še nisem, ker sem študentka oz. absolventka 2. Msc Znanost o živalih.
Mentor pri magisterski nalogi: doc. dr. Gorjanc
Naslov (delovni) magisterskega dela: Načrt parjenj pri lipicanskem konju (Mate selection)
Rok za končanje: letos :)

Zanima me delo s konji, na vseh področjih: učenje konj, uporaba v terapevtske namene, dresura...ter genetika in selekcija.

Rokovala sem se že z računalniški programi: SAS, R, VCE, PEDIG, PEST, SQL Developer - vendar sem pri vseh še precej v osnovah, zato se na tem področju želim še precej izpopolniti.

Trenutno se ukvarjam z rodoslovnimi podatki lipicanskih konj. Zaradi spreminjanja sistemov in načina urejanja baz so le-ti precej pomešani in vsebujejo ogromno napak. Nekatere lahko rešimo z logičnimi preveritvami, nekatere ostanejo večna uganka. Zato želimo izpeljati sistem, ki bi s pomočjo rodoslovnih podatkov, mitohondrijske DNA (rodovi) in podatkih o y-kromosomu (linije), omogočil postaviti najbolj optimalno rodoslovje in izločiti večino nelogičnih napak, ki so se ukoreninile skozi 500-letno zgodovino.

Cilj magisterske naloge pa je, na podlagi ustreznega rodoslovja, pripraviti optimalen načrt parjenja za slovesnko populacijo konj, ki je problematična iz vidika majhnosti in težav z inbridingom.

Poleg tega pa pomagam pri izvedbi raziskovalnega projekta Izkustveno izobraževanje otrok s pomočjo konj, kjer ugotavljamo ali druženje s konji vpliva pozitivno na počutje otrok.

Interesi za prihodnost: Genomska selekcija na področju konjereje.

Lepo vas pozdravljam,

Barbara

[dubravko škorput]

Pozdrav svima,

 

Ime: Dubravko

Prezime Škorput

 

Zaposlen: Sveučilište u Zagrebu Agronomski fakultet

Naslov disertacije: Genetski parametri za proizvodna svojstva i svojstva plodnosti u populaciji svinja u Hrvatskoj

 

Postdiplomski studij: Poljoprivredne znanosti

Rok za končanje doktorata: veljača (februar) 2014

Znanstveni interes: kvantitavna genetika

 

Najčešće korišteni software: SAS; VCE; PEST; R

 

Pozdrav,

 

Dubravko

 

Dubravko Škorput, dipl. ing.
Agronomski fakultet
Svetošimunska cesta 25  Zagreb
Zavod za specijalno stocarstvo
+385 1 2393 651
dsko...@agr.hr

 

Dubravko Škorput, BsC
Faculty of Agriculture
Department of Animal science
Svetošimunska cesta 25  Zagreb
+385 1 2393 651
dsko...@agr.hr

[Petra Filipović]

Lep pozdrav tudi v mojem imenu!

 

Ime: Petra

Priimek: Filipović

 

Zaposlena: Še nisem ker sem študentka 2. letnik msc Znanost o živalih

Mentor pri magisterski nalogi: doc. dr. Gregor Gorjanc
Naslov (delovni) magisterskega dela: Struktura svetovne populacije rjavega goveda (Brown Swiss).
Rok za končanje: september 2014

 

Zanimajo me predvsem selekcijska in populacijska genetika, pa tudi konjereja.

 

Tekom mojega študija sem se srečala z naslednjimi programi: SAS, R, PLINK in STRUCTURE trenutno pa delam z programom ADMIXTURE preko Linux terminala vendar sem pri vseh še precej v osnovah, zato bi se na tem področju želela še precej izpopolniti.

 

Lep pozdrav

Petra Filipović

[tamara.gregorcic]

Lep pozdrav vsem

Ime: Tamara

Priimek: Gregorčič

Študentka 1. letnika msc Znanost o živalih

Mentor pri diplomskem projektu doc. dr. Gregor Gorjanc.

Naslov: Frekvence alelov gena PrP pri ovcah v Sloveniji.

Naslov magisterskega dela še ni izbran.

Pri študiju se srečujem s programi: SAS, R, PLINK, PEST, VCE

Interes: genomika, selekcija

Lep pozdrav,

Tamara Gregorčič

 

 

 

 

Dne četrtek, 11. april 2013 12:57:17 UTC+2 je oseba petra.modribiro napisala:

[dsko...@agr.hr]

Pozdrav svima,

Pozivam vas na obranu moga doktorskog rada koja će se održati 29.7.
2013. (ponedjejak) u 11 sati na Agronomskom fakultetu Sveučilišta u
Zagrebu. Naslov disertacije je "Evaluation of genetic parameters for
productive and reproductive traits in pig population in Republic of
Croatia". Veselim se vašem dolasku,

Pozdrav,

Dubravko

[Barbara Bračič]

Hvala za povabilo. Žal se ne morem udeležiti zagovora, vendar ti želim vso srečo.

S pozdravi,

Barbara

2013/7/9 <dsko...@agr.hr>

[Janez Jenko]

Živjo,

Jaz planiram, da grem na zagovor. Če želi še kdo, pa nima prevoza, se lahko zapelje z mano.

lp, Janez

[Gregor Gorjanc]

Jaz bom imel par prostih mest, ker sem v komisiji. Ce nas bo samo za en avto greste z mano.

--
-- 
With regards!

----------------------------------------------------------------------
University of Ljubljana     Asst. Prof. Gregor Gorjanc, PhD
Biotechnical Faculty        www: http://sites.google.com/site/gregorgorjanc
Animal Science Department   blog: http://ggorjan.blogspot.com
Groblje 3                   mail: gregor.gorjanc <at> bf.uni-lj.si
SI-1230 Domzale             fax: +386 (0)1 724 10 04
Slovenia, Europe            tel: +386 (0)1 320 38 61
----------------------------------------------------------------------

--
Lep pozdrav!

----------------------------------------------------------------------
Univerza v Ljubljani        doc. dr. Gregor Gorjanc
Biotehniška Fakulteta       www: http://sites.google.com/site/gregorgorjanc
Oddelek za zootehniko       blog: http://ggorjan.blogspot.com
Groblje 3                   mail: gregor.gorjanc <at> bf.uni-lj.si
1230 Domžale                fax: +386 (0)1 724 10 05
Slovenija                   tel: +386 (0)1 320 38 61
----------------------------------------------------------------------

[Vesna Mrak]

Hoj,

jaz imam že rezerviran dopust, tako da se vama pridružim.

LP,
Vesna