Realtime PCR

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Oct 24, 2008, 2:49:28 AM10/24/08
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编辑本段Realtime PCR(实时定量PCR)
  定量PCR已经从基于凝胶的低通量分析发展到高通量的荧光分析技术,即实时定量PCR。实时荧光定量PCR技术于1996年由美国Applied
Biosystems公司推出,由于该技术不仅实现了PCR从定性到定量的飞跃,而且与常规PCR相比,它具有特异性更强、有效解决PCR污染问题、自
动化程度高等特点。实时定量PCR (real-time quantitative PCR)是指在PCR指数扩增期间通过连续监测荧光信号强弱的变
化来即时测定特异性产物的量,并据此推断目的基因的初始量,不需要取出PCR产物进行分离。目前实时定量PCR作为一个极有效的实验方法,已被广泛地应
用于分子生物学研究的各个领域。
  实时荧光定量PCR 技术的主要应用:
  1. DNA 或RNA 的绝对定量分析:包括病原微生物或病毒含量的检测,转基因动植物转基因拷贝数的检测,RNAi 基因失活率的检测等
  2. 基因表达差异分析:例如比较经过不同处理样本之间特定基因的表达差异(如药物处理、物理处理、化学处理等 ),特定基因在不同时相的表达差异
以及cDNA 芯片或差显结果的确证
  3. 基因分型:例如SNP 检测,甲基化检测等
  Realtime PCR 常用的两种方法分别为:Sybr green(荧光染料掺入法) 和Taqman probe (探针法)
  SYBR green
  在PCR反应体系中,加入过量SYBR荧光染料,SYBR荧光染料特异性地掺入DNA双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的SYBR染料分子不会发
射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与PCR产物的增加完全同步。
  此方法适用:
  1、灵敏度高:使用SYBR可使荧光效果增强到1000倍以上
  2、通用性好,不需要设计探针,方法简便,省时,价格低廉。
  3、通用型方法,在国内外科研中普遍使用。
  4、高通量大规模的定量PCR检测
  5、专一性要求不高的定量PCR检测。
  Taqman Probe
  PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针,该探针为一寡核苷酸,两端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。探针完整时,
报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的5’-3’外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监
测系统可接收到荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与PCR产物形成完全同步
  此方法适用:
  1、具有高适应性和可靠性,实验结果稳定重复性好,特异性更高。
  2、适用于扩增序列专一的体系的检测。
  3、样品中靶基因含量过低的定量PCR检测。
  4、靶基因的特异序列较短,无论怎样优化引物设计条件都不能解决。
  5、存在与靶基因同源的序列,在PCR中容易出现非特异性扩增,对特异性要求较高的定量。
  6、广泛用于人类传染病的诊断和病原定量,在动物病原体基因的检测,畜禽产品的检验检疫,生物制品的鉴定。
  (来源:GENELIFE Biotech 基莱生物)
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