Hola Chisv
Como vas a conectar tu bluetooth a la FPGA no importa los pines que uses para recibir y transmitir. Lo único que has de tener presente (y que se explica en el
vídeo) es que el RX del bluetooth lo conectes al pin que tu FPGA que vaya a transmitir (TX), y lo mismo con el otro pin, el TX del bluetooth va al RX de tu FPGA. TX y RX son pines que tú has decidido en el diseño que cumplan esa función.
Otra cosa diferente es cuando enviamos/recibimos información desde el ordenador, ya hay un chip (el FT2232H) que se encarga de eso y está definido sus pines en las Alhambras o en otras FPGA que llevan ese chip.
Por ejemplo, usa TX como D0 y RX como D1. Entonces has de conectar D0 (TX) al pin RX de tu bluetooth, y D1 (RX) al pin TX de tu bluetooth.
Saludos.