En principio podrías cambiar cualquiera de los parámetros en MIDI o en Audio. Pero si es cierto que a veces, la automatización MIDI en pistas de instrumento virtual no responde bien, por lo que te aconsejo que lo hagas en el audio.
Para utilizar la herramienta cambio de duración tienes que:
1. Seleccionar las notas MIDI que quieras cambiar de duración.
2. Botón derecho sobre una de ellas y "Operaciones de evento / Cambiar duración".
3. En la ventana que aparece vas a la casilla "Configurar todo en" y pones el valor que quieras asignar a las notas.
4|000 la redonda.
2|000 la blanca.
1|000 la negra.
0|480 la corchea.
0|240 la semicorchea.
etc.
Ten en cuenta que la negra se subdivide en 960 tics (unidad creada para los secuenciadores). Si quisieras saber cual es el valor de una corchea en un tresillo de corcheas tendrías que dividir 960/3 = 320 tics.
Saludos