Normalmente, eso sólo ocurre si los compases no tienen música. Si hay música escrita Finale va a adecuar el ancho de los compases a la cantidad de notas que haya dentro de ellos.
También, puedes probar los espaciados que te ofrece Finale.
1. Selecciona los compases que tu quieras.
2. Ve al menú "Utilities / Music Spacing" y selecciona uno de los tipos de espaciados. El primero te aplica un espaciado de nota, el segundo de pulso y el tercero de compás. Para lo que quieres hacer el mejor es el tercero.
También puedes hacerlo manualmente.
Selecciona la herramienta de compás

.
A todos los compases les aparecen unos cuadraditos de selección en la línea divisoria. Puedes arrastrar ese cuadradito hacia derecha e izquierda y así cambiar su tamaño.
Saludos