Para borrar las páginas en blanco tienes que seleccionar la herramienta de maquetación

, ir al menú "Page Layout/Delete Blank Pages" y en la ventana que aparece asegurarte que está activada la opción "From page 1 through end of piece". Pulsas OK.
Algunas veces Finale suele dejar una página en blanco y por más que insistes en borrarla el programa no lo hace.
Eso suele ser porque el último sistema de la partitura está muy ajustado al borde inferior del folio. La solución es arrastrar ese último sistema un poquito hacia arriba. De esa forma te elimina la página en blanco.