Hola,
con lo que realmente hay que tener cuidado en los grupos irregulares en Finale, es con el valor de la primera nota del grupo.
La razón es porque Finale va a dejar un "hueco" determinado dependiendo de esa primera nota. Es decir, si le digo a Finale que quiero un tresillo y la primera nota que introduzco es una negra, Finale dejará un "hueco" para un tresillo de negras. Si la primera nota del tresillo es una corchea, dejará un "hueco" para uno de corcheas.
Mira estos cuatro tresillos:
Todos los he hecho con la herramienta de notación rápida

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El primero.
He pulsado Ctrl + 3 para que Finale sepa que voy a hacer un tresillo. A continuación he puesto una corchea, una semicorchea y una corchea. Después he movido el cursor con flecha izquierda hasta ponerme sobre el "do" y le he añadido el puntillo.
El segundo.
Un tresillo normal.
El tercero:
He pulsado Ctrl + 3 para que Finale sepa que voy a hacer un tresillo. A continuación he puesto dos corcheas. Después he movido el cursor con flecha izquierda hasta ponerme sobre el "la" y le he dado el valor de negra.
El cuarto:
He pulsado Ctrl + 3 para que Finale sepa que voy a hacer un tresillo. A continuación he puesto una corchea y tres semicorcheas. Después he movido el cursor con flecha izquierda hasta ponerme sobre el "do" y le he dado valor de semicorchea Por último, he movido el cursor con flecha derecha a la derecha del "fa" y he añadido el "sol" corchea.
Saludos