關於regress out covariates

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s110...@gmail.com

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Jun 27, 2017, 9:03:05 PM6/27/17
to 成大心智影像研究中心-線上諮詢服務
您好:
我想請問,在使用REST分析的時候,我們嘗試去除一些Covariates,motion、CSF、WM。Motion我們使用SPM8前處理所產生的motion檔案 rp.xxxxx;CSF和WM則是使用REST程式自身的CsfMask_07_61x73x61和 WhiteMask_09_61x73x61 。 我們先將CSF和WM的使用Extract ROI Signals 提取出每個受試者的signal ,並且將提取出的2訊號加到motion檔案後面,形成一個8個軸的txt檔案,並且使用Regress Out Covariates移除。

目前我們遇到的問題是我們發現移除motion、csf、wm後,結果變得很奇怪,受試者的自身的FC變得很大,幾乎每個都是在0.9左右,但是各受試者間差異又很大,和完全沒有校正作出來的結果很像,我們也有嘗試單純只移除motion,結果變化還比較大。另外我們也檢查了signal的確是有變化,所以應該regress out covariates有效果。已經想請問,中心過去也有移除csf、wm也有和沒有移除差不多的情況嗎? 中心一般在分析,大部分是用什麼方法regress out motion、csf、wm呢?

另外請問大部分都是先進行Filter 然後regress out covariates,還是先regress out covariates 再filter?

謝謝

葉丁瑞

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Jun 27, 2017, 10:30:58 PM6/27/17
to DC L, 成大心智影像研究中心-線上諮詢服務
您好

分析時沒有 regress out CSF和wm,僅regress out motion。請問移除CSF和WM的依據是?

剛開啟您所稱的這兩個Mask,Mask區域跟理解上有點不同。請開啟此兩個檔案"CsfMask_07_61x73x61"和"WhiteMask_09_61x73x61 "查看。

"CSF和WM則是使用REST程式自身的CsfMask_07_61x73x61和 WhiteMask_09_61x73x61 。"

WhiteMask_09_61x73x61 如下圖。WM位置跟理解的差異有點大,建議使用自身的CSF和WM mask。
http://i.imgur.com/c4vIg9N.png

Inline image 1



Q2:
另外請問大部分都是先進行Filter 然後regress out covariates,還是先regress out covariates 再filter?
習慣先filter再regress out covariates。

丁瑞



Yeh Ting-Jui
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s110...@gmail.com

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Jun 28, 2017, 5:57:05 AM6/28/17
to 成大心智影像研究中心-線上諮詢服務, s110...@gmail.com
感謝您的回覆,讓我獲益良多^^。
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