[Resting State]是否本來就可以使用T1_01來進行前處理即可?

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Justlive Huang

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Dec 28, 2017, 1:55:16 AM12/28/17
to 成大心智影像研究中心-線上諮詢服務

最近碰到一些問題,想請問一下有關做RESTING的突發奇想。

通常要做resting state的前處理時,
要準備以下檔案:
1. T1的img/hdr檔案。2. resting的img/hdr檔案。

T1是跟著做resting實驗時,一起掃描下來的結構檔。

如果有種狀況如下:
當T1已經掃描完了(簡稱T1_01),但受測者臨時下了設備(尿急,急事接電話...etc),
然後再回來掃描,通常建議重新掃描一次T1(簡稱T1_02),然後再繼續掃描resting state。

可是我們在前處理時,例如使用SPM,本來就會校正AC-PC連線,
當受測者雖然離開機器,但大腦明顯沒有經過外力變形,
是不是根本就不需要用使用T1_02來進行前處理。
是否本來就可以使用T1_01來進行前處理即可?

我的問題是:

這種狀況,是否本來就可以使用T1_01來進行前處理即可?



以上一點小問題,想請教各位老師和學長
謝謝

葉丁瑞

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Dec 28, 2017, 3:53:09 AM12/28/17
to Justlive Huang, 成大心智影像研究中心-線上諮詢服務
您好

理論上你的想法沒有錯。

不過有一個比較標準的作法,因為你已經結束了一個掃描序列,會拿同一個掃描序列的結構影像進行分析。

延伸的討論,

假設你是做前後測的rsfMRI,但中途受試者離開了MRI,該如何處理?

我的作法會是前後測分開進行normalization再進入1st level的分析,以免head motion過大。

丁瑞

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【您的問題】
最近碰到一些問題,想請問一下有關做RESTING的突發奇想。

Yeh Ting-Jui
Member of Mind Research and Imaging  Center, National  Cheng Kung University
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Chun-Yu Lin

unread,
Dec 28, 2017, 4:23:26 AM12/28/17
to 葉丁瑞, Justlive Huang, 成大心智影像研究中心-線上諮詢服務
理論上用收取時間較近、同一session的 structural image 來 normalise 應該效果較好,特別若是用同 slices、orientation 的T1的話
(若都是 SPGR ,甚至截的收取 volume 位置都差不多,可能差異不大)

但建議可實際比較不同 normalise 方法的結果看看
至少用肉眼檢查、比較看看結果是否有明顯差異
(平常每位受試固定方法的 normalization 也建議都還是肉眼檢查一下最好,看有無偏差太多的個案)

更可利用軟體做一些比較
e.g., SPM 可對兩種方法得出的結果圖相減,看看是否差異區域很大

提供參考囉~ :)
CY


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國立成功大學心理學系 林君昱 助理教授
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