spm的2nd level analysis分析相關問題

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lynn...@gmail.com

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Oct 3, 2016, 3:31:10 AM10/3/16
to 成大心智影像研究中心-線上諮詢服務
我想要詢問有關用spm的2nd level analysis分析的問題。
我已完成1st level analysis，每個受試者輸出的ps file裡的腦圖都有顯現資料，但在進行2nd level analysis的分析後，所輸出的ps file裡的腦圖皆為空白的。嘗試使用neuroelf做分析，所跑出來的腦圖是有呈現顯著差異的部分。想問說這有可能是spm的哪個設定環節出錯嗎?

葉丁瑞

unread,
Oct 3, 2016, 3:48:42 AM10/3/16
to lynn...@gmail.com, 成大心智影像研究中心-線上諮詢服務
你可以貼一下圖檔嗎?

不太懂你說的  "ps file裡的腦圖皆為空白的"的意思?

neuroelf若有顯著差異，SPM和neuroelf的校正(FWE or none)和threshold是否相同?

丁瑞

Yeh Ting-Jui
Member of Mind Research and Imaging  Center, National  Cheng Kung University
No.1,University Road,Tainan City 701,Taiwan
       +886(6)2353535#6269
Fax: +886(6)2004848
Email : dingruey88@gmail.com

2016-10-03 15:31 GMT+08:00 <lynn...@gmail.com>:
我想要詢問有關用spm的2nd level analysis分析的問題。
我已完成1st level analysis，每個受試者輸出的ps file裡的腦圖都有顯現資料，但在進行2nd level analysis的分析後，所輸出的ps file裡的腦圖皆為空白的。嘗試使用neuroelf做分析，所跑出來的腦圖是有呈現顯著差異的部分。想問說這有可能是spm的哪個設定環節出錯嗎?

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葉丁瑞

unread,
Oct 3, 2016, 4:19:18 AM10/3/16
to fmri...@googlegroups.com, lynn...@gmail.com
您好

SPM 你用的是FWE，而neuroelf用的是0.05，有校正過嗎?

Inline image 1


Yeh Ting-Jui
Member of Mind Research and Imaging  Center, National  Cheng Kung University
No.1,University Road,Tainan City 701,Taiwan
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From: Lynn Lin <lynn...@gmail.com>
Date: 2016-10-03 16:15 GMT+08:00
Subject: Re: spm的2nd level analysis分析相關問題
To: 葉丁瑞 <dingr...@gmail.com>


附件為所產生的ps file 轉為pdf file和neuroelf所分析出來的結果


Li-Chun Lin (Lynn), M.S.
National Cheng Kung University
1_1.PNG
spm_2016Oct03.pdf

葉丁瑞

unread,
Oct 3, 2016, 4:33:29 AM10/3/16
to Lynn Lin, fmri...@googlegroups.com
您好

online上有很多資料可以看，搜尋Familywise error rate (FWE) & MRI 應該可以找到很多資料。

可參考

若有疑問再來信討論。

丁瑞

Yeh Ting-Jui
Member of Mind Research and Imaging  Center, National  Cheng Kung University
No.1,University Road,Tainan City 701,Taiwan
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Fax: +886(6)2004848
Email : dingruey88@gmail.com

2016-10-03 16:25 GMT+08:00 Lynn Lin <lynn...@gmail.com>:

此未校正過，我沒發現我spm那邊點選了FWE,已解決，謝謝。想另外詢問FWE的功用為何？

Chun-Chia Kung

unread,
Oct 4, 2016, 9:22:31 AM10/4/16
to 葉丁瑞, Lynn Lin, Fmrincku
我這裡分享一些使用上的心得:

原則上，由於 fMRI 對於 發現位置的報告有相當的理由預期所報告出的結果應該是經過統計檢定中針對多種考驗(whole brain comparsion)所做的校正，故原則上如果是呈現結果中是有校正過的，即可以大方的報告出來(當然要跟你的問題有關，或是結果是值得報告的)。但有時擔心的是校正太多次(如 1st level 一次，second-level 又一次。原則上應該擇一 step 做校正即可; 或太嚴謹，或太 liberal, 這樣的情況下似乎也都不太好。

此外，Bonferroni, FWE, or FDR 在 fMRI 校正分析上的使用，似乎使用的頻率也伴隨著時間而演進。網路上亦有一些不錯的簡介影片:

hope these help,
俊嘉

On Oct 3, 2016, at 4:33 PM, 葉丁瑞 <dingr...@gmail.com> wrote:

您好

online上有很多資料可以看，搜尋Familywise error rate (FWE) & MRI 應該可以找到很多資料。

可參考

若有疑問再來信討論。

丁瑞

Yeh Ting-Jui
Member of Mind Research and Imaging  Center, National  Cheng Kung University
No.1,University Road,Tainan City 701,Taiwan
       +886(6)2353535#6269
Fax: +886(6)2004848
Email : dingruey88@gmail.com

2016-10-03 16:25 GMT+08:00 Lynn Lin <lynn...@gmail.com>:

此未校正過，我沒發現我spm那邊點選了FWE,已解決，謝謝。想另外詢問FWE的功用為何？


On Oct 3, 2016 4:19 PM, "葉丁瑞" <dingr...@gmail.com> wrote:
您好

SPM 你用的是FWE，而neuroelf用的是0.05，有校正過嗎?

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