ご回答とサンプルのご提供ありがとうございます。
PointCloudDensityTiler の定義を確認したら、ご解説のように、ポイント数を保証する処理がありませんでした。
添付していただいたカスタムトランスフォーマーで試した結果、以下のような結果を得ることができました。今回単純にエリアで一定数でポイント分けたいので、これで一応目的を達成です。NeighborFinder と Loop で使う方法とても参考になりました。

理想を言えば、ポイントの密度を考慮して分割できればいいなと思います。
まだ完全に理解していない部分がありますが、以下の記事を参考して、ホットポイントを中心にしてポイントを分割する方法を考えています。もし何かいいアイデアがあれば是非教えていただきたいです。