FME 2016.0.1.0
JpMeshCodeExtractorを利用して、JGD 2000 7系の図郭ポリゴンから2次メッシュコードを取得しています。

取得した_meshcodeを確認すると、6桁の2次メッシュコードではなく、以下のようなマイナス記号付きの13桁数字になっています。
また、jpmeshcodeextractor.meshtypeは<missing>となっています

試に、座標系をJGD 2000に変換して再度確認したら、6桁の2次メッシュコードを取得できるようになりました。

JpMeshCodeExtractorのヘルプを読みますと、以下のように書かれています。
”This transformer is valid only for a geographic data on Japanese area with LL coordinate system. ”
このLL coordinate systemはJGD 2000のことでしょうか?