Extraire Base de données d'une CAH Factoshiny

[Célia Maghakian]

Bonjour,

J'ai effectué une classification ascendante hiérarchique sous R à la suite d'une ACM sur une base de données avec des variables quali, avec le package Factoshiny.

J'ai obtenu 3 classes.

J'aimerais savoir les effectifs d'individus pour chacune des classes, ainsi que récupérer ma BdD initiale avec pour chaque individu une variable supplémentaire "Classe" (3 modalités : Classe1, Classe2 et Classe3) pour de futures analyses.

Est-ce possible ?

Pourriez-vous m'aider ?

Merci par avance pour votre réponse

Célia Maghakian

[Francois Husson]

Bonjour,
Pour cela, il faut passer par ligne de code.
Donc une fois que vus avez fait ACM et classif sur Factoshiny, cliquer plus bas sur le bouton "Lignes de code". Celles-ci s'affficheront en haut de la page. Vous pouvez les copier, sortir de Factoshiny, puis les coller dans la fenêtre de commande. Cela refera l'analyse à l'identique.
Vous pouvez alors récupérér le tableau de données avec une dernière colonne qui contient le n° de classe (colonne clust).

res.hcpc$data.clust

Et pour avoir les effectifs de chaque classe il suffira de faire :

table(res.hcpc$data.clust$clust)

FH

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En 2022, Agrocampus Ouest devient l'Institut Agro Rennes-Angers.