Comportement etrange de FAMD et Plot.FAMD

[sam kl]

Bonsoir,
En utilisant les fonctions FAMD et plot.FAMD dans une filière Analyse factorielle - Clustering, j'ai obtenu un message d'erreur dans le resumé de FAMD lorsque l'on place une variable qualitative en supplémentaire:

Supplementary categories
Erreur dans mat[, indice + nb.col * (0:(ncp - 1))] <- obj$contrib[1:nbelements,  :
  le nombre d'objets à remplacer n'est pas multiple de la taille du remplacement

Ce message n'apparait qu'avec des variables qualitatives placées en supplémentaires. Les variables numériques supplémentaires ne posent pas de pbm

De plus, dans la fonction plot.FAMD, il y a des erreurs de coloration de modalités lorsque l'on choisit "choix="quali" et habillage = index qualitative (voir script plus bas)

Je travaille avec la derniere version de R, de Factominer et de R-studio.
Ces deux "bugs" se produisent quel que soit le jeu de données, avec ou sans valeur manquante et sans échantillonnage préalable.
Voici le code pour reproduire les défauts dans la console:

data(wine)
afdm<-FAMD (wine, ncp = 4, graph = F, sup.var = 1, axes = c(1,2), row.w = NULL, tab.comp = NULL)
summary(afdm)
plot.FAMD(afdm, axes=c(1,2), choix="quali", habillage = 2, lim.cos2.var=0, lab.var=T, col.lab=F)
windows()
plot.FAMD(afdm, axes=c(1,2), choix="quali", habillage = 1, lim.cos2.var=0, lab.var=T, col.lab=F)

Merci pour votre aide
Très bonne soirée

Samuel
 

[François Husson]

Merci pour votre message. J'ai résolu ces 2 problèmes dans la nouvelle version 1.27 de FactoMineR que je soumettrai au CRAN d'ici peu.

En attendant, je vous envoie le package en fichier zip (pour windows).

[François Husson]

Et le package en fichier tar.gz (pour linux et mac).

Le mercredi 30 juillet 2014 21:50:54 UTC+2, sam kl a écrit :

[sam kl]

Bonjour,
MERCI!
Cdt