probleme de libellés des individus avec HCPC

[Raphaël Aulas]

Bonjour 

Merci tout d'abord pour cette fascinante librairie Factominer. 

Même si je commence à bien maitriser cette librairie et en découvre la puissance chaque jour, il me reste des marges importantes de progression.

Je suis face à un problème. 

J'ai un nombre d' ' individus' le libellé  de ces individus   est dans la colonne 2. 

Je fais une ACP, sans soucis. 

T1.PCA <- T1.data %>% select ( 1 , 3, 4:12 )  %>% PCA(, quali.sup = 1)

J'ai à ce moment les libellés ( colonne 1)  qui apparaissent dans le graphe.

Mais HCPC ( T1.PCA, nb.clust=3) "perd" les  libellés. 

Ainsi, 

HCPC$data.clust ne me renvoie ces libellés, mais les numéros de lignes. 

J'ai raté un truc?  

 

[François Husson]

Bonjour,

Je pense que vous faites une erreur car il me semble que vous considérez que la 1ère colonne est une variable (en l'occurrence une variable qualitative que vous mettez en supplémentaire). Or ce n'est pas une variable, mais un libellé. Il faut donc que cela correspond aux rownames du data set.

Essayez en faisant :
rownames(T1.PCA) <- T1.PCA[,1]
res.pca <- PCA(T1.PCA[,3:12])
HCPC(res.pca)

Ou avec du dplyr:
rownames(T1.PCA) <- T1.PCA[,1]
T1.data %>% select ( 3, 4:12 )  %>% PCA()

HCPC ( T1.PCA, nb.clust=3)

FH

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[Raphaël Aulas]

ah oui, tout à fait. 

merci