Noms des points sur ACP des individus

[Fortenpommes]

Bonjour,

J'ai un souci qui est apparu depuis peu sous FactoMineR: une fois le graphique de l'acp des individus établit, les noms des points n'apparaissent plus sur le graphique mais sont remplacés par des numéros (correspondant au nombre total de points).
la commande de base donnée renvoyée par FactoMineR est:
plot.PCA(res,axes=c(1,2),choix="ind", habillage=none, col.ind="black",col.ind.sup="blue",col.quali="magenta",label=c("ind","ind.sup","quali"),new.plot=TRUE)

Voici un extrait de mon tableau de données de départ:

souris ACC CD36 CHREBP FAS categorie H2 4,80194641 2,34919296 3,74202786 5,22264406 NR H8 1,42426024 1,37263148 1,24846585 1,17356627 NR H11 1,62564635 1,53633963 2,06208921 0,98747869 NR H15 1,09699011 0,9193164 1,18799184 0,76139882 NR H16 0,45857988 0,70313779 0,52682157 0,81927786 NR H21 0,1705259 0,45313267 0,26294402 0,33682861 NR H23 2,88469045 1,9216702 2,59137972 2,2133098 NR H31 0,17626128 0,21230449 0,17310728 0,30008765 NR H40 2,38974796 2,23655077 3,38162387 1,14494507 NR H46 0,86288112 0,75525309 0,41581187 1,03406266 NR H10 2,86911478 6,75549811 1,95316348 3,60039035 R H27 0,2554345 1,38925756 0,25308205 1,08760577 R H33 0,51932774 2,05350837 0,5061155 1,3411204 R H35 2,14039441 4,08140863 1,86258588 3,38697222 R H36 0,84653383 2,6099939 0,39315936 1,72088893 R H37 2,5894552 3,81965284 1,50367735 3,02456633 R H41 1,68391772 3,31004795 2,88667506 6,22678435 R H42 0,12121246 0,930196 0,08211298 0,55548925 R H50 4,12986885 4,84086819 1,92229992 2,94366032 R
Comment faire pour qu'apparaisse sur le graphique, les noms "H2", "H8", "H11" etc. pour chacun des points? J'ai essayé d'insérer text(Données[,1]) dans le plot.PCA(res, axe=c(1,2)...) mais ça ne change rien. En vous remerciant de votre réponse, Cordialement,

[François Husson]

Bonjour,

C'est votre importation du jeu de données qui est mal faite.

Il faut préciser que la première colonne contient le nom des individus car sinon la première colonne est considérée comme une variable qualitative (utiliser row.names=1).

FH

[Rm]

Bonjour!
Pour un jeu de données déjà actif, j'utilise parfois la commande : NOUVELLE-MATRICE <- data.frame(ANCIENNE-MATRICE[,-1], row.names=ANCIENNE-MATRICE[,1])
Cela prélève les noms contenus dans la première colonne pour nommer les lignes.
Rm.

[Fortenpommes]

Merci de votre réponse, ça venait effectivement de là. Mon problème est résolu!
Encore merci!

Le mercredi 10 décembre 2014 15:34:00 UTC+1, François Husson a écrit :