RE: Quel est le v.test réalisé dans HCPC "$desc.var" ?
Gilles le Pape
Voir Husson, Lê & Pagès, 2009. Analyse des données avec R. Presses unversitaires de Rennes, pages 150 et 151.
Bien cordialement.
Gilles
De : factomin...@googlegroups.com [mailto:factomin...@googlegroups.com] De la part de Isabelle Tritsch
Envoyé : mardi 29 novembre 2016 12:44
À : FactoMineR users <factomin...@googlegroups.com>
Objet : Quel est le v.test réalisé dans HCPC "$desc.var" ?
Bonjour,
Après avoir réalisé une classification ascendante hiérarchique, je souhaite décrire mes groupes selon les variables qui les distinguent significativement les uns des autres.
Avec la fonction desc.var j'obtiens pour chaque groupe et chaque variable quantitative le v.test, mean in category, overall mean, et p.value (cf. exemple si dessous)
Cependant, pour les variables quantitatives, je ne comprend pas de quel test il s'agit (v.test) ? est-ce le Chi2 ??
Exemple :
res.hcpc$desc.var
$quanti$quanti$`1` v.test Mean in category Overall mean sd in category Overall sd p.value
Indic1.Maximum -5.633716 2.5796786 7.919663 1.8782382 6.270494 1.763670e-08
Indic4.Frequency -5.914873 0.5862069 1.821429 0.4925123 1.381517 3.321308e-09
Indic2.Cumulative -6.691526 5.7921213 25.482010 3.2722387 19.465913 2.208552e-11
Indic3.Mean -6.740904 0.5979857 2.385834 0.3369733 1.754564 1.574047e-11
$quanti$`2` v.test Mean in category Overall mean sd in category Overall sd p.value
Indic2.Cumulative 5.257751 45.578061 25.482010 8.7023662 19.465913 1.458280e-07
Indic3.Mean 4.754729 4.023898 2.385834 0.7056862 1.754564 1.987130e-06
D'avance merci pour votre aide !
Bien cordialement,
Isabelle
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Gilles le Pape
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Gilles
De : factomin...@googlegroups.com [mailto:factomin...@googlegroups.com] De la part de Isabelle Tritsch
Envoyé : mardi 29 novembre 2016 14:01
À : FactoMineR users <factomin...@googlegroups.com>
Objet : Re: Quel est le v.test réalisé dans HCPC "$desc.var" ?
Mon message précédent a été tronqué. voici l'explication du v.test :
Les tests menés correspondent à l'idée suivante : dans une population d'effectif N (ici N=100), on tire au hasard sans remise un échantillon de taille n (ici, n est l'effectif de la classe, n=18). Quelle est la probabilité d'observer un écart au moins aussi élevé entre la moyenne d'échantillon et la moyenne de la population ?
Le principe du calcul est le suivant : pour chaque variable et chaque classe, on calcule la moyenne des valeurs de la variable sur les individus constituant la classe, la moyenne sur l'ensemble des individus l'écart type (non corrigé)des valeurs de la variable sur les individus constituant la classe et l'écart type (non corrigé) s de l'ensemble des valeurs sur tous les individus des observations. On calcule ensuite la valeur test selon la formule donnée par Escoffier et Pagès.
On calcule ensuite la p-value correspondante pour un test bilatéral, en utilisant une loi normale centrée réduite. Cette p-value indique si la moyenne de la classe est significativement différente de celle de l'ensemble, pour la variable considérée.
Le mardi 29 novembre 2016 13:58:03 UTC+1, Isabelle Tritsch a écrit :
Bonjour et merci pour votre réponse.
j'ai en effet trouvé une explication "longue" sur ce v.test (cf. ci-dessous) mais je n'arrive pas à la synthétiser clairement (cf ci-dessous)
En fait c'est pour répondre à un reviewer. "what is the "v.test" referred to here? Please clarify what tests are being used" alors que j'avais déjà précisé qu'il s'agissait du package FactoMineR, de la fonction HCPC et catdes.
Merci !
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