Ha oui ! C'est pas un "petit" cours d'eau, c'est déjà sérieux. A vue de nez 1er catégorie.
Attention, il est complètement interdit de barrer un tel cours d'eau sans une flanquée d'autorisations qui te seront refusées pour un motif si futile.
De même, il est fort probable que tu sois obligé de déclarer un puisage sous peine d'amende. Tu auras des limitations de quantités prélevées (mais bien au dela de ce que consomme une maison)
Contacte ta mairie ou mieux, ta MISE régionale (Mission Inter Services de L'eau).
Si jamais tu as l'autorisation, il existe plein d'astuces pour prélever de l'eau sans sédiment.
Crépine à contre courant avec pente à sédiments, décanteur gravimétrique ou cyclonique, lit de sable, ...
Oubli d'entrée de jeu un bête filtre mécanique qui se colmatera en quelques semaines !
Une solution bien plus simple : un forage à quelques mètres du cours d'eau, donc dans le lit majeur.