Cytoscape開発チームの大野です。
現在、月末のリリースを目指して、Cytoscapeの新バージョン2.7.0のテストを行っております。主な変更点としましては、
1. 階層構造の表現 (Nested Networks)
http://cytoscape.wodaklab.org/wiki/RFC_Nested_Networks
2. インタラクションデータの共通Web Service APIのサポート(これは外部プラグインとして提供します)
http://code.google.com/p/psicquic/
3. BioPAX Level 3サポート
4. KEGGデータの可視化サポート(これも外部プラグインとして近日公開予定です)
http://keiono.tumblr.com/post/385544026/kegg-kgml-will-be-supported-soon-in-cytoscape
などがあります。2と4に関しては、後ほどプラグインとしてリリースしますので、もう暫くお待ちください。
現在のベータ版はこちらからダウンロード可能です。
http://chianti.ucsd.edu/Cyto-2_7-beta/
また、ナイトリービルド版もこちらからダウンロードしていただけます(Build Artifactsと言うリンクです):
http://chianti.ucsd.edu:8081/cruisecontrol/buildresults/cytoscape
お使いになられて、何か問題点やバグ等を発見された方はご一報ください。出来る限りリリース前に対応したいと思いますので。
よろしくお願いします。
大野
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Keiichiro Ono ko...@ucsd.edu
Cytoscape Core Developer Team: http://www.cytoscape.org/
UCSD School of Medicine Trey Ideker Lab: http://chianti.ucsd.edu/idekerlab/