ご無沙汰しております、Cytoscape開発チームの大野です。
さて、遅れていたCytoscape2.6.0の方をリリースしましたので、お知らせいたします。今回のリリースでは、主にネットワークやアノテーションのデータを簡単に取りこめるような機能を追加しました。Biomart,
NCBI Entrez Gene, IntAct, Pathway
Commonsといった外部データベースに直接接続して、ネットワークを取りこんだり、アノテーションをロードすることがプラグインにより可能になります。
最新版は、サイトの方からダウンロードしていただけます:
http://www.cytoscape.org/index.php
機能紹介のページも新しくしましたので一度ご覧下さい:
http://www.cytoscape.org/features2.php
なお、これからユーザーの方々から不具合の報告などが上がって来ると思いますので、少しずつそういったものも直していきます。その毎日自動構築される最新版は、こちらからダウンロードできます:
http://chianti.ucsd.edu:8081/cruisecontrol/buildresults/cytoscape
(Build Artifactsのリンクから)
UCSD大野
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Keiichiro Ono ko...@ucsd.edu
Cytoscape Core Developer Team: http://www.cytoscape.org/
UCSD Bioengineering Ideker Lab: http://chianti.ucsd.edu/idekerlab/