Re: Re: Cytoscape 上で グローバルな 代謝パスウェイを扱いたい

[Kozo Nishida]

返信が送れ真に申し訳ありません
奈良先端大の西田です．

> 後方互換性は１００％確保するつもりです。一般的なオフィスアプリケーションのように、以前のバージョンで作成されたファイルは読み込む事が出来、そこに新機能が必要なファイルの場合はv3のフォーマットでセーブできるようにする予定です。

承知しました．ありがとうございます．

> 位置情報を含んだネットワークを作成するには二つの方法があります。

> 1. XGMML/GMLなどの位置情報を含むファイルを作成する
> 2. スクリプトを使う

ご助言ありがとうございます．
自分はXSLTに疎く，RubyやPythonに慣れているので後者の方法でやってみます．
ノードだけでなくエッジに関しても同様の作業を行うつもりです．
また質問させて頂くかもしれませんが よろしくお願いいたします．

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Kozo Nishida(koz...@is.naist.jp)

Laboratory of Comparative Genomics
Graduate School of Information Science
Nara Institute of Science and Technology