You do not have permission to delete messages in this group
Copy link
Report message
Show original message
Either email addresses are anonymous for this group or you need the view member email addresses permission to view the original message
to cytoscape-discuss-j
Agilent literature searchで構築したネットワークのノードattributeに、
GeneOntology(特にBiological process)をインポートしたいのですが、
うまく出来ません。
Import Ontology and annotation、Import Attribute from Biomart /
NCBI Entrez Gene Web serviceのいずれからもうまくインポートすることが
できませんでした。
Agilent literature searchでは、ノードattributeのIDがgene symbolになっており、
これをなんらかの(例えばEntrez Gene)IDに変換すれば良いようなことがユーザー
マニュアルや、本家のCytoscape-discussなどに書いてあるのですが、操作方法が
よく分かりません。
ちなみに、Bubble routerをインストールしたのでCellular componentは
Data panelのnode attribute browserから見ることができます。
操作方法に関して、ご教授いただきたいのですが、宜しくお願い致します。
環境はCytoscape 2.6.2、Agilent literature search 2.70です。