Спасибо за ответ!
Применение Poincaré map я видел в модели Magnetic Lens из Model Library. Только в Вашем примере, как я понял, цвет частичек зависит от расстояния от оси модели.
Сделать трехмерную модель не проблема (для Poincaré map нужна только 3D модель). Только я не вижу что от туда можна вытащить в числах для меня.
Еще в докуметации Particle Tracing Module есть такая фраза:
The Freeze option (default) fixes the particle position and velocity at the instant a wall is struck ………… This boundary condition is typically used to recover the velocity or energy distribution of charged particles at the instant contact was made with the wall.
То есть, существует возможность восстановить значения скорости и энергии частиц после столкновения если задана опция Freeze. Но опять же я не нашел как это можно сделать.