Una de las mayores desventajas al usar Software Libre en una empresa y migrar sin hacer un proceso, es que existe muy poco soporte serio en el mercado.
Es decir, muchas veces una persona que sepa de Linux te puede dar su opinión acerca de una distribución específica, pero por lo general muy pocas empresas dan un soporte de la talla de UBUNTU, quien tiene una distribución única y exclusivamente para empresas, asi como para Educación. y quien da soporte 24/7 (24 horas del día y 7 días a la semana). Pero obviamente esto tiene un costo adicional, y realmente es esto lo que busca ofrecer UBUNTU, un servicio y no tanto el producto, ya que es libre. Pero aún así no se compararía este costo con el pago de una licencia de Windows. Además de UBUNTU existen otras empresas relacionadas con este tipo de soporte como lo es NOVELL, quienes tienen una versión de SUSE para empresas y prestan el mismo servicio del anterior.