Here is the complete script
set terminal jpeg size 1024,768
set output "dssp.gnu.jpg"
set pm3d map corners2color c1
set ytics 1.000, 1.000
set ytics("ASN:100" 1.000,"LEU:101" 2.000,"ASP:102" 3.000,"ALA:103" 4.000,"LEU:104" 5.000,"HD1:105" 6.000,"ASP:106" 7.000,"HIP:107" 8.000,"LEU:108" 9.000,"ALA:109" 10.000,"THR:110" 11.000,"ILE:111" 12.000,"TYR:112" 13.000,"PRO:113" 14.000,"GLY:114" 15.000,"MET:115" 16.000,"ARG:116" 17.000,"ALA:117" 18.000,"PRO:118" 19.000,"SER:119" 20.000,"PHE:120" 21.000,"ARG:121" 22.000,"CYS:122" 23.000,"THR:123" 24.000,"ASP:124" 25.000,"ALA:125" 26.000,"GLU:126" 27.000,"LYS:127" 28.000,"GLY:128" 29.000,"LYS:129" 30.000,"GLY:130" 31.000,"LEU:131" 32.000,"ILE:132" 33.000,"LEU:133" 34.000,"HIE:134" 35.000,"TYR:135" 36.000)
set cbrange [ -0.500: 7.500]
set cbtics 0.000 7.000 1.0
set palette maxcolors 8
set palette defined (0 "#000000",1 "#0000FF",4 "#00FF00",7 "#FF0000")
set cbtics("None" 0.000,"Para" 1.000,"Anti" 2.000,"3-10" 3.000,"Alpha" 4.000,"Pi" 5.000,"Turn" 6.000,"Bend" 7.000)
set xlabel "Frame"
set ylabel ""
set yrange [ 0.000: 38.000]
set xrange [ 0.000:7002.000]
splot "-" with pm3d title "dssp.gnu"
1.000 1.000 0
1.000 2.000 4
1.000 3.000 4
1.000 4.000 4
1.000 5.000 4
1.000 6.000 4
1.000 7.000 4
1.000 8.000 4
and so on ....
file is large
this script is produced by CPPTRAJ tool.