Нет, первичный ключ не является уникальным. Может быть вставлено много строк с одинаковым значением первичного ключа.
Идемпотентность вставки есть для совсем другого случая: для таблиц типа ReplicatedMergeTree при вставке блока данных, содержащего такие же строки в таком же порядке, как у блока данных, вставленного ранее. Подробнее смотрите в документации, поиск по слову "идемпотентность".