Oi, Ricardo
Cada tipo base de distribuição tem seu próprio tipo de pacote para
instalação. Recomendo que você entenda os principais (debian, mandriva, gentoo, red hat e mais algum outro de sua preferência, por
exemplo) e crie um pacote para cada uma delas. Na base, são quase todas
um pacote tipo "tar.gz" de todos os seus arquivos e mais uma lista de
dependências de bibliotecas, módulos, serviços e outros arquivos.
Como existem divergências entre as distribuições no tocante a
localização de certos arquivos e bibliotecas, não conheço nem acredito
que exista algum instalador genérico no estilo Windows.
Mas afinal mesmo no Windows, que tem um único "empacotador" da distribuição básica, existem dessas divergências...
Abraços a todos
Francisco
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"If you have an apple and I have an apple and we exchange apples then you and I will still each have one apple. But if you have an idea and I have one idea and we exchange these ideas, then each of us will have two ideas." - George Bernard Shaw