Boa noite!
Não entendi direito o que você quer dizer com "aplicação".
Se for para consultas / alterações "ad hoc" tem o próprio Mongo shell que também permite de executar programas em javascript. Ou a excelente ferramenta gráfica da MongoDB: o
Compass, que na sua mais nova versão tem um gerador de "piplines" do aggregate(), ótimo para consultar coleções ("tabelas") de muitas formas.
Se for para escrever uma app mesmo, tem vários tutoriais online tipo MEAN stack (Mongo, Express, Angular, Node) ou MERN (react em vez de Angular). Um que achei excelente é o do
Traversy Media: Learn the MERN stack (em 7 partes) que explica as coisas bem passo a passo.
Espero ter ajudado!
abraço
Ronald
PS: essa foi ótima: 'bando de dados"