2025年11月のBio"Pack"athonについて

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露崎弘毅

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Nov 16, 2025, 6:01:00 PMNov 16
to ngs-...@googlegroups.com, bioinfor...@googlegroups.com
MLのみなさま

千葉大の露崎です。
生命科学で利用されるデータベースやデータ解析手法をパッケージにするハッカソンであるBio"Pack"athonに関してお知らせです。

11月19日(水)17:00からの回では、東京大学の中戸隆一郎先生に「シングルセル解析プラットフォーム ShortCake の紹介」というタイトルでご講演いただきます。

ShortCakeは、シングルセル解析で利用する各種ツールを Docker、Jupyter Notebook、RStudio など多様な環境で利用可能にした統合プラットフォームです。
この環境により、100種類以上のツールを煩雑なインストール作業なしで直ちに利用できるようになります。

cf.
https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btaf559
https://github.com/rnakato/ShortCake

また、私も最近のLLM/AIに関する幾つかのトピックを紹介する予定です。

参加登録は以下からお願いします。
https://biopackathon.connpass.com/event/372831/

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Koki Tsuyuzaki
Department of Artificial Intelligence Medicine,
Graduate School of Medicine, Chiba University, Japan
Institute for Advanced Academic Research (IAAR),
Chiba University, Japan
Project Lecturer
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