Que tal Carlos,
Acabo de preguntar a uno de los ingenieros que cubre la parte de grabaciones y me comenta que no es un tema del navegador, la grabacion simplemente no funciona en iOS por el codex que utiliza.
Tendrias que modificar los scripts en tu serivodr BBB para producir mp4 y registrar el codex.
Si tquieres profundizar en el tema te recomendaria que te subscribas al grupo de desarrollo, anunque es en ingles. Todos los que ven la parte de grabaciones navegan ese foro.
Saludos,
JF