Olá, nunca utilizei o Webmin para restore, mas com o Webacula não tive problemas(tenho vários arquivos com nomes acentuados e todos funcionaram nos testes), já com o BAT os arquivos são restaurados sem problemas(só que não aconselho fazer restore parcial de vários jobs ao mesmo tempo, pois já tive problemas de um job que era restauração parcial acabar restaurando full). Já verificou se é algum problema de encode? Talvez na interface dele tenha como modificar o charset para UTF-8(que aceita acentos) ou algo do tipo.