Si estás usando el servicio de red para generar tus copias de seguridad, éstas se almacenarán en el directorio /var/lib/backharddi-ng del servidor. Una copia de seguridad es un directorio con el nombre que le hayas dado a la copia de seguridad sustituyendo algunos caracteres (como espacio y "/") por guiones bajos ("_"). Una vez localizada el directorio de la copia de seguridad, puedes borrarlo desde el gestor de archivos o desde consola con el comando rm.
Si estás usando el modo HD, las copias de seguridad se estarán almacenando en una partición ext3 con etiqueta "backharddi". Deberás localizar dicha partición, montarla, localizar el directorio que almacena la copia de seguridad y borrarlo de la misma forma que en el modo de red.
Un saludo.