A ver hay varias formas de poder usar dispositivos externos, hay que tener en cuenta, que las lecturas no son 'conflictivas' en cuanto a una extracción (sólo afectará a que si un programa estaba leyendo se quedará a medias), pero las escrituras si.
Por lo general desde hace muchos años, en cualquier dispositivo de almacenamiento, su operación más lenta es la escritura y para evitar que la misma haga de cuello de botella suelen implementar un buffer a nivel software (algunos dispositivos como discos duros tiene buffer también a nivel hardware para llevar el rendimiento a otro nivel). Este buffer hace de intermediario para que la escritura sature menos el sistema y permita hacer la escritura cuando se considera más oportuno a nivel físico.
Algunos dispositivos/sistemas operativos permiten desactivar el uso de este buffer, de forma que cuando escribes x bytes, y dice que ha acabado, realmente ha acabado y la extracción segura como tal (que suele ser vaciar los buffers pendientes de escritura y operaciones pendientes de fichero para asegurar que todo está correctamente guardado) no suele afectar.
En contra de lo anterior, al desactivar el buffer, la escritura de ficheros en ese dispositivo se ve afectada negativamente en la velocidad y rendimiento convirtiéndose en una unidad muy muy lenta para esa operación, incluso dependiendo del equipo, afectando al rendimiento del equipo, y si ya hay un antivirus de por medio que quiere analizar dicha escritura... ni os cuento.
Según lo anterior, si, se puede configurar la unidad de tarjetas para que no haya que hacer extracción segura, pero que nadie se queje si al hacerlo parece que su ordenador ha envejecido una década o más al trabajar con la sd.
Yo personalmente prefiero tener el buffer que optimiza enormemente la escritura en sd y preocuparme simplemente antes de hacer la extracción en pulsar extraer y esperar unos segundos.
Decir que debería venir de fabrica desactivado, es una señal de que no has verificado las consecuencias de tal operación y trabajas poco con ese dispositivo. Normalmente eso provoca lags enormes, perdida de rendimiento innecesario, etc... Puede que en tu caso, sólo uses la tarjeta de forma muy esporádica y para escrituras pequeñas, pero no tiene por que ser la generalidad. Las SD se usan para muchas cosas (entre ellas cámaras digitales con ficheros de pesos considerables).
Esta bien informar que se puede activar o desactivar, pero también indicando las consecuencias.
Saludos.