こんにちは
WindowManager.LayoutParams attrs = getWindow().getAttributes();
// ここで、attrs.flags に対して「WindowManager.LayoutParams.FLAG_FULLSCREEN」
// ビット演算でフラグを切り替える。
//
// attrs.flags |= WindowManager.LayoutParams.FLAG_FULLSCREEN
// attrs.flags &= (~WindowManager.LayoutParams.FLAG_FULLSCREEN)
getWindow().setAttributes(attrs);
うる覚えですが、これでいけたと思います。