HWND WINAPI GetActiveWindow(void);
http://msdn.microsoft.com/en-us/library/windows/desktop/ms646292(v=vs.85).aspx http://stackoverflow.com/questions/115868/how-do-i-get-the-title-of-the-current-active-window-using-c
Mas em AIR Flex só achei como pegar o nome das janelas do próprio aplicativo AIR, ou seja, as janelas internas do sistema.
Se tiver alguem tiver alguma informação fico grato.Fabiano