Durch die Verwendung von Left Option als Mod3-Taste interpretieren einige Programme Ebene 3-Eingaben als Shortcut, anstatt das entsprechende Symbol auszugeben. Abhängig von der Anwendung kann dies der Shortcut mit dem jeweiligen Ebene 3-Zeichen sein, oder der Shortcut mit dem Zeichen auf der Grundebene. Webseiten im Browser sehen im Allgemeinen die Ebene 3-Zeichen, native Anwendungen meistens letzteres. Dieses Problem kann durch eine der beiden Karabiner Elements Complex Modifications umgangen werden:
Diese Regel wandelt eine einzelne Ebene 3-Taste in eine spezielle Tottastensequenz um, die von Programmen nicht mehr als Shortcut interpretiert werden kann, aber unter Umständen andere Probleme mit sich bringt. Insbesondere führt diese Regel dazu, dass in JetBrains IDEs ein zusätzliches ungewolltes Zeichen eingefügt wird. Ein entsprechendes Bugticket wurde bereits vor längerer Zeit erstellt. Folgender Workaround existiert aber: