Fwd: [apimet-sepmet] 1 Poste MC UM ouvert à PHIM- Génétique quantitative et physiologie moléculaire- Design expérimentaux et analyses données multivariées
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Boubacar A. KOUNTCHE
Feb 22, 2024, 9:05:02 AM2/22/24
to reseau-doctorants-nigeriens
Boubacar
-------- Message transféré --------
bonjour
Un poste de Maitre de Conférence de l'UM est ouvert, avec un possible rattachement recherche dans l'unité PHIM
Merci de faire suivre dans vos réseaux
bonne journée
jean-benoit Morel
*/Poste de Maître de Conférence Université de Montpellier/*
*/Fermeture des candidatures le 29 mars 2024/*
*//*
*/_Intitulé : Enseignement en amélioration et sélection végétales. Recherche en génétique et approches omiques pour la compréhension et l'amélioration du fonctionnement des plantes dans des environnements variables._/*
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Contact : jean-ben...@inrae.fr
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*Le _descriptif complet_ du poste est disponible sur Galaxie <https://www.galaxie.enseignementsup-recherche.gouv.fr/ensup/cand_postes_GALAXIE.htm#1EC> (Université de Montpellier, Poste #178)*
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*Profil Enseignement*
Enseignement en amélioration et sélection végétales. Implication dans les formations en alternance.
La personne recrutée sera intégrée au département Biologie-Mécanismes du Vivant (Bio-MV) et en particulier à l’équipe pédagogique Biologie fonctionnelle des plantes (développement / nutrition / interactions avec l'environnement abiotique et biotique). Elle sera principalement chargée d’enseignements dans le domaine de l’amélioration et de la sélection des plantes : génétique formelle, génétique moléculaire et quantitative ainsi qu’en /design/ de plans d’expérimentation végétales et dans les analyses statistiques associées, notamment l'analyse de données massives.
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*_La personne recrutée devra choisir sa thématique de recherche parmi les 2 profils Recherche à PHIM (Plant Health Institute of Montpellier) et résumés ci-dessous ou dans l’Institut AGAP (voir Galaxie)._*
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*Profil Recherche 1 « Bases génétiques de la fixation d‘azote des Légumineuses Tropicales cultivées » - équipe BALI <https://umr-phim.cirad.fr/recherche/comprendre-le-phytobiome-phytobiom/equipe-bali>*
La personne recrutée mènera ses travaux au sein de l’Équipe BALI de l'UMR PHIM et participera aux travaux de recherche visant à comprendre et améliorer la fixation biologique de l’azote chez les légumineuses tropicales cultivées. L’azote est un des principaux facteurs limitants de la production agricole en zone sahélienne. Les légumineuses sont capables de fixer l’azote en s’associant avec des rhizobia mais ce trait a rarement été ciblé par les programmes de sélection. Les travaux menés par l’équipe en partenariat avec l’UMR AGAP et l’ISRA au Sénégal ont permis de caractériser la diversité des bactéries associées à l’arachide au Sénégal puis de cartographier des QTLs liés à la fixation d’azote en utilisant une population de croisement interspécifique. La caractérisation de ces QTLs est actuellement en cours en combinant des études de microscopie, de transcriptomique et une cartographie fine des régions impliquée. Par ailleurs nous exploitons également une population de 300 variétés africaines d’arachide pour identifier des QTLs liés à la fixation d’azote en utilisant une approche GWAS. La personne recrutée aura une expertise en génétique quantitative et développera ce type d’approche pour étudier les bases génétiques de la fixation biologie de l’azote sur des légumineuses tropicales cultivées (arachide, niebé, vigna mungo…).
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*Profil Recherche 2« Plasticité phénotypique des interactions plantes/pathogènes » - équipe MOMIE <https://umr-phim.cirad.fr/recherche/comprendre-le-phytobiome-phytobiom/equipe-momie>*
Les facteurs environnementaux ont un impact considérable sur la résistance aux agents pathogènes.
Les mécanismes de priorisation entre la mise en place d’une résistance à un stress biotique et une tolérance à un stress abiotique restent toutefois un front de science. À l’aide des dispositifs mis en place dans l’UMR PHIM (Institut de Santé des Plantes de Montpellier), l’équipe MOMIE a quantifié l’effet de perturbations de l’environnement sur la résistance à un pathogène, notamment en appliquant des analyses GWA, chez le blé ou chez le riz qui sont les modèles de l’équipe. Dans le cas des mélanges de variétés, l’association génétique avec le phénotype a pu être analysé de manière originale puisque dans ce cas l’environnement, constitué par une plante voisine, est défini génétiquement. Dans l’ensemble, les recherches proposées font appel à des dispositifs expérimentaux multifactoriels impliquant notamment des aspects GXE et nécessitant des approches statistiques multivariées. Ces approches seront utilisées pour mieux comprendre l’efficacité de la mise en place de la résistance dans des environnements agroécologiques basés sur l’utilisation de bio-solutions. La personne recrutée contribuera donc à caractériser la plasticité phénotypique de la résistance aux agents pathogènes dans des environnements biotiques (plantes voisines dans les mélanges) et/ou abiotiques (biostimulant, stimulateur des défenses, stress hydrique …) variables, en ligne avec les enjeux liés au changement climatique et au développement de solutions agroécologiques.
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From: Isabel MARTIN-GRANDE <isabel.mar...@supagro.fr>
Date: Thu, Feb 22, 2024 at 1:14 PM
Subject: [apimet-sepmet] 1 Poste MC UM ouvert à PHIM- Génétique quantitative et physiologie moléculaire- Design expérimentaux et analyses données multivariées
To: <reseau-api...@googlegroups.com>
From: Isabel MARTIN-GRANDE <isabel.mar...@supagro.fr>
Date: Thu, Feb 22, 2024 at 1:14 PM
Subject: [apimet-sepmet] 1 Poste MC UM ouvert à PHIM- Génétique quantitative et physiologie moléculaire- Design expérimentaux et analyses données multivariées
To: <reseau-api...@googlegroups.com>
Et vive le réseau:)
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| Sujet : | Poste MC UM ouvert à PHIM- Génétique quantitative et physiologie moléculaire- Design expérimentaux et analyses données multivariées |
|---|---|
| Date : | Thu, 22 Feb 2024 13:41:35 +0100 |
| De : | jean-benoit MOREL <jean-ben...@inrae.fr> |
bonjour
Un poste de Maitre de Conférence de l'UM est ouvert, avec un possible rattachement recherche dans l'unité PHIM
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jean-benoit Morel
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*/_Intitulé : Enseignement en amélioration et sélection végétales. Recherche en génétique et approches omiques pour la compréhension et l'amélioration du fonctionnement des plantes dans des environnements variables._/*
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Contact : jean-ben...@inrae.fr
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*Le _descriptif complet_ du poste est disponible sur Galaxie <https://www.galaxie.enseignementsup-recherche.gouv.fr/ensup/cand_postes_GALAXIE.htm#1EC> (Université de Montpellier, Poste #178)*
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*Profil Enseignement*
Enseignement en amélioration et sélection végétales. Implication dans les formations en alternance.
La personne recrutée sera intégrée au département Biologie-Mécanismes du Vivant (Bio-MV) et en particulier à l’équipe pédagogique Biologie fonctionnelle des plantes (développement / nutrition / interactions avec l'environnement abiotique et biotique). Elle sera principalement chargée d’enseignements dans le domaine de l’amélioration et de la sélection des plantes : génétique formelle, génétique moléculaire et quantitative ainsi qu’en /design/ de plans d’expérimentation végétales et dans les analyses statistiques associées, notamment l'analyse de données massives.
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*_La personne recrutée devra choisir sa thématique de recherche parmi les 2 profils Recherche à PHIM (Plant Health Institute of Montpellier) et résumés ci-dessous ou dans l’Institut AGAP (voir Galaxie)._*
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*Profil Recherche 1 « Bases génétiques de la fixation d‘azote des Légumineuses Tropicales cultivées » - équipe BALI <https://umr-phim.cirad.fr/recherche/comprendre-le-phytobiome-phytobiom/equipe-bali>*
La personne recrutée mènera ses travaux au sein de l’Équipe BALI de l'UMR PHIM et participera aux travaux de recherche visant à comprendre et améliorer la fixation biologique de l’azote chez les légumineuses tropicales cultivées. L’azote est un des principaux facteurs limitants de la production agricole en zone sahélienne. Les légumineuses sont capables de fixer l’azote en s’associant avec des rhizobia mais ce trait a rarement été ciblé par les programmes de sélection. Les travaux menés par l’équipe en partenariat avec l’UMR AGAP et l’ISRA au Sénégal ont permis de caractériser la diversité des bactéries associées à l’arachide au Sénégal puis de cartographier des QTLs liés à la fixation d’azote en utilisant une population de croisement interspécifique. La caractérisation de ces QTLs est actuellement en cours en combinant des études de microscopie, de transcriptomique et une cartographie fine des régions impliquée. Par ailleurs nous exploitons également une population de 300 variétés africaines d’arachide pour identifier des QTLs liés à la fixation d’azote en utilisant une approche GWAS. La personne recrutée aura une expertise en génétique quantitative et développera ce type d’approche pour étudier les bases génétiques de la fixation biologie de l’azote sur des légumineuses tropicales cultivées (arachide, niebé, vigna mungo…).
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*Profil Recherche 2« Plasticité phénotypique des interactions plantes/pathogènes » - équipe MOMIE <https://umr-phim.cirad.fr/recherche/comprendre-le-phytobiome-phytobiom/equipe-momie>*
Les facteurs environnementaux ont un impact considérable sur la résistance aux agents pathogènes.
Les mécanismes de priorisation entre la mise en place d’une résistance à un stress biotique et une tolérance à un stress abiotique restent toutefois un front de science. À l’aide des dispositifs mis en place dans l’UMR PHIM (Institut de Santé des Plantes de Montpellier), l’équipe MOMIE a quantifié l’effet de perturbations de l’environnement sur la résistance à un pathogène, notamment en appliquant des analyses GWA, chez le blé ou chez le riz qui sont les modèles de l’équipe. Dans le cas des mélanges de variétés, l’association génétique avec le phénotype a pu être analysé de manière originale puisque dans ce cas l’environnement, constitué par une plante voisine, est défini génétiquement. Dans l’ensemble, les recherches proposées font appel à des dispositifs expérimentaux multifactoriels impliquant notamment des aspects GXE et nécessitant des approches statistiques multivariées. Ces approches seront utilisées pour mieux comprendre l’efficacité de la mise en place de la résistance dans des environnements agroécologiques basés sur l’utilisation de bio-solutions. La personne recrutée contribuera donc à caractériser la plasticité phénotypique de la résistance aux agents pathogènes dans des environnements biotiques (plantes voisines dans les mélanges) et/ou abiotiques (biostimulant, stimulateur des défenses, stress hydrique …) variables, en ligne avec les enjeux liés au changement climatique et au développement de solutions agroécologiques.
-- Directeur de PHIM (Plant Health Institute of Montpellier) https://umr-phim.cirad.fr/ Contacts: Direction PHIM:phim...@cirad.fr Recherche:jean-ben...@inrae.fr Tél :+33499624837 Portable: +33687425617 Adresse postale: CIRAD Département Bios Campus International de Baillarguet UMR PHIM TA A-120/K 34398 Montpellier CEDEX 05 _____ Il se peut que vous receviez ce message à des heures matinales, tardives ou le week-end. Il ne nécessite, en aucune façon, une réponse de votre part en dehors des heures ouvrées.
Vous recevez ce message, car vous êtes abonné au groupe Google Groupes "Le réseau APIMET SEPMET".
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Cette discussion peut être lue sur le Web à l'adresse https://groups.google.com/d/msgid/reseau-apimet-sepmet/9ee56611-8f13-db09-106b-159f3237780f%40supagro.fr.
Boubacar A. Kountché,
Research Scientist | Chercheur Généticien Mil Génétique & Innovation Variétale (GIV) Team | BIOS UMR AGAP Institute | CIRAD
Bâtiment 03bis, Bureau 152 | TA A-108/03 | Av. Agropolis, 34398 Montpellier Cedex 5
Bâtiment 03bis, Bureau 152 | TA A-108/03 | Av. Agropolis, 34398 Montpellier Cedex 5
Mobile: +33 (0)7 45 61 40 63 | Office : +33 (0)4 67 61 58 00 (extn 5396)
E-mail: boubacar...@cirad.fr | b.kou...@gmail.com
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