Olá Romulo,
Realmente deve existir algum sistema que seja necessário ofuscar/criptografar(o que como eu disse, pouco ou nada adianta), podemos brincar, ofusque uma conexão mysql_connect(), poste o código e resto da lista tenta descobrir o usuário e senha ? Levando em consideração que: php codigoPhpOfuscado.php deve rodar, assim, simulamos uma maquina de um cliente com código ofuscado.
Infelizmente eu nunca desenvolvi um sistema tão ultra secreto que justificasse não ser open source, relacionado a segredo de estado ou coisa do tipo. Claro que praticamente tudo que desenvolvi como funcionário, não foi Open Source, por mera incapacidade de compreensão dos meus superiores.
Sinceramente, posso estar falando besteira, mas 90% das situações, os softwares de Goiás poderiam ser software livre, não são por mero desconhecimento do que é software livre, por achar que software livre é software gratuito e outras coisas mais. Mas enfim, como você disse, não vamos gerar flames. Afinal, estou aprendendo sobre mercado e principalmente, mercado de software livre. Mas o que eu tenho certeza é; existe uma carência muito grande :/. Desculpem o off.
[]s