Pelo que vc disse o VSC está compilando o firmware sem erros e eu estou imaginando que é o part cooler que está querendo fazer funcionar e, também, que já deve ter tentado outros pinos na placa.
Essa linha que vc marcou aí, na minha versão do Marlin (bugfix 2.0 fiz) está comentada acho que não é por aí que vc vai resolver.
Eu tive problema com a mini pq troquei os pinos, e o cooler só ligava quando o hotend subia de 50º, eu tinha ligado no FAN1, quando o certo era ligar o part cooler no FAN_0, não sei se a GTR é assim.
Tente ligar a placa no pc via cabo usb, conecte pelo pronterface e, por ele, clique em "fan on" o gráfico de temperatura deve indicar que o FAN está ligado.
Se ainda não estiver funcionando, vale a pena dar uma revisada no Marlin, este vídeo pode ser de alguma ajuda.
Boa sorte.