Francisco saludos, la base de datos esta montada en un servidor GNU/Linux CentOS 6.5, no creo que sea el caso.
Revise los logs y no veo nada anormal, ni los de CentOS ni el de MySQL.
He optado por subir la copia y repetir los movimientos que se hicieron el día 2 de septiembre que no fueron muchos, por lo menos eran mucho menos que los del día 31.
Ahora bien, sigo con la intriga de lo que pudo haber sucedido. ¿Tendrá algo que ver el espacio en el disco duro? es que note que tenia cerca de 1G de espacio libre en el disco duro. He eliminado una cantidad de espacio para ver si eso tiene algo que ver.
Gracias por los comentarios y lo dejo acá para ver si a alguien le ha sucedido y nos pueda (por lo menos a mi) aclarar que puedo haber pasado. He puesto el tema en un grupo de CentOS y voy a hacer lo mismo en grupos de MySQL, solo para ver si alguno de ellos es el responsable, jejejeje. En serio, el detalle ha incomodado un poco al cliente y me pide que le explique que sucede.
Saludos.
Alejandro.